1、显微影像分析 

  与多种光学和电子显微仪器相关的高通量成像技术、快速三维重建技术及大规模影像数据分析技术，主要应用于微观尺度神经连接图谱绘制、纳米工艺芯片电路网表提取等。
 

2 、图像与视频处理

  光学及多光谱等图像数据的分辨率增强、序列配准、目标检测及运动估计，主要用于视频信号、卫星图像等的大体量数据处理与快速分析。

              
主要技术涉及模式识别、深度学习、视频分析等方面的数学建模、算法研究及工程化实现。

欢迎自动化、计算机、电子、数学、物理、生物等专业优秀学生报考，具有直博生和硕博连读生招生名额。

招生专业：模式识别与智能系统

招生方向：显微影像分析，图像与视频处理

 

微观重建团队包括脑微观重建与智能分析研究组和显微分析技术平台，开展大体量突触水平微观重建技术研究，处于国内先进水平。

 

脑微观重建与智能分析研究组工作人员10名，包括正高1名，副高3名，中级4名，加入中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心。

 

显微分析技术平台工作人员4名，拥有大型仪器设备20余台套，其它设备20余台套，总价值4000万元，加入中科院北京生命科学大型仪器区域中心。

 

 

 

081104-模式识别与智能系统
081203-计算机应用技术

2001-09--2004-08   中国科学院研究生院   博士
1996-09--1999-04   中国舰船研究院   硕士
1992-09--1996-07   西安交通大学   学士

1992～1996年，西安交通大学电气工程学院自动化系，学士学位。 
1996～1997年，中国科学技术大学自动化系，学习硕士学位课程。 
1997～1999年，中国舰船研究院系统工程专业，硕士学位。
2001～2004年，中国科学院自动化所模式识别与智能系统专业，博士学位。 

2008.6~2015.8，任国家专用集成电路设计工程技术中心研发部总工程师。 

2009.1~2014.8，任核高基国家科技重大专项xxx课题组长、总设计师（牵头单位）。

2015.1~           ，任脑微观重建团队负责人、显微分析技术平台负责人。

2015-07~现在, 中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心, 年轻骨干
2014-10~现在, 中国科学院自动化所, 高级工程师（正研级）
2007-06~2014-10,中国科学院自动化所, 高级工程师
2004-08~2007-06,中国科学院自动化所, 助理研究员
1999-04~2001-08,中国船舶重工集团第716所, 工程师

 

 

 

 

 

 

 

（1） 中国科学院关键技术人才, 院级, 2015专利成果

（ 1 ） 一种基于MCA的图像超分辨率重建方法, 发明, 2015, 第 1 作者, 专利号: ZL 201110014847.1

（ 2 ） 一种基于图像边缘保持自适应分解的超分辨率重建方法, 发明, 2014, 第 2 作者, 专利号: ZL 201110014854.1

（ 3 ） 基于带限二维EVD与Gabor自适应滤波的图像时频分析法, 发明, 2014, 第 2 作者, 专利号: ZL 201110014849.0

（ 4 ） 利用自适应多尺度基本形式实现图像融合的方法, 发明, 2014, 第 3 作者, 专利号: ZL 201110014854.2

（ 5 ） 一种基于多尺度基本形式的相似尺度图像融合方法, 发明, 2014, 第 1 作者, 专利号: ZL 201110014846.7

（ 6 ） 小波邻域高斯模型图像复原方法, 发明, 2014, 第 2 作者, 专利号: ZL 201110014853.7

（ 7 ） 一种对扫描电子显微镜畸变进行校正的方法, 发明, 2015, 第 2 作者, 专利号: ZL 201110014855.6

（ 8 ） 显著化神经切片膜结构的等离子刻蚀工艺及图像合成方法, 发明, 2015, 第 1 作者, 专利号: 2015104505368

（ 9 ） 基于双光子图像的突触检测方法, 发明, 2016, 第 2 作者, 专利号: 201610716189.3

（ 10 ） 基于电镜序列切片图像的突触检测方法, 发明, 2017, 第 2 作者, 专利号: 201610802612.1

（ 11 ） 基于序列切片的显微镜图像采集方法, 发明, 2016, 第 2 作者, 专利号: 201610978135.4

（ 12 ） 基于线粒体结构的图像配准方法及装置、存储介质及设备, 发明, 2017, 第 2 作者, 专利号: 201710610438.5

（ 13 ） 生物组织序列切片显微图像的配准方法及装置, 发明, 2017, 第 2 作者, 专利号: ZL 201710638426.3

（ 14 ） 低能量背散射电子探测器II, 发明, 2017, 第 2 作者, 专利号: ZL 201710936186.5

（ 15 ） 低能量背散射电子探测器, 发明, 2017, 第 2 作者, 专利号: ZL 201710935508.4

（ 16 ） 面向序列切片的扫描电镜图像实时配准装置及方法, 发明, 2017, 第 2 作者, 专利号: ZL 201711248908.4

（ 17 ） 多幅显微图像拼接中的灰度矫正方法及装置, 发明, 2017, 第 3 作者, 专利号: ZL 201711287182.5

（1） Deep Contextual Residual Network for Electron Microscopy Image Segmentation in Connectomics, 2018 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, 2018, 通讯作者
（2） non-iterative simultaneous rigid registration method for serial sections of biological tissue, 2018 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, 2018, 第 2 作者
（3） 基于深度学习的脑微观重建, Brain Microstructure Reconstruction Based on Deep Learning, 系统工程理论与实践, 2018, 通讯作者
（4） An Automated Pipeline for Bouton, Spine, and Synapse Detection of In vivo Two-photon Images of Mouse, Biodata Mining, 2018, 通讯作者
（5） An Unsupervised Network for Fast Microscopic Image Registration, SPIE Medical Imaging,2018, 2018, 第 4 作者
（6） A Novel Fully Deep Convolutional Neural Networks for Mitochondria Segmentation Based on ATUM-SEM, SPIE Medical Imaging,2018, 2018, 通讯作者
（7） Formation mechanism of anodic titanium oxide in mixed electrolytes, Materials Research Bulletin, 2017, 通讯作者
（8） An efficient method for neuronal tracking in electron microscopy images, The 2017 IEEE International Conference on Mechatronics and Automation(ICMA), 2017, 第 6 作者
（9） Large scale three-dimensional reconstruction of an entire Caenorhabditis elegans larva using AutoCUTS-SEM, Journal of Structural Biology, 2017, 第 7 作者
（10） 脑微观重建系统研究, Micro reconstruction system for brain, 系统工程理论与实践, 2017, 通讯作者
（11） GAN based Sample Simulation for SEM-Image Super Resolution, CCF Chinese Conference on Computer Vision, 2017, 第 4 作者
（12） Image Deformation Using modified Moving Least Squares with outlines, The 2017 IEEE International Conference on Mechatronics and Automation(ICMA), 2017, 第 6 作者
（13） Grayscale Inhomogeneity Correction Method for Multiple Mosaicked Electron Microscope Images, International Conference on Graphic and Image Processing(ICGIP), 2017, 第 4 作者
（14） Automatical Detecting and Connecting the Mitochondria From the Serial EM Images, The 2017 IEEE International Conference on Mechatronics and Automation(ICMA), 2017, 第 6 作者
（15） Microscopic Neural Image Registration based on the Structure of Mitochondria, SPIE Medical Imaging, 2017, 通讯作者
（16） Deep Learning and Shapes Similarity for Joint Segmentation and Tracing single Neurons in SEM images, SPIE Medical Imaging, 2017, 通讯作者
（17） An Automated Pipeline for Mitochondrial Segmentation on ATUM-SEM Stacks, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2017, 通讯作者
（18） Neurons secrete miR-132-containing exosomes to regulate brain vascular integrity, Cell Research, 2017, 第 8 作者
（19） Watershed learning merge tree used for segmenting neurons in SEM images, The 2017 IEEE International Conference on Mechatronics and Automation(ICMA), 2017, 通讯作者
（20） Automatically Segmenting and Reconstructing Neurons in SEM images, The 2016 IEEE International Conference on Mechatronics and Automation(ICMA), 2016, 通讯作者
（21） Sequentially Supervised Long Short-Term Memory for Gesture Recognition, Journal Cognitive Computation, 2016, 第 3 作者
（22） 3D-reconstruction of synapses based on EM images, The 2016 IEEE International Conference on Mechatronics and Automation(ICMA), 2016, 通讯作者
（23） Wrinkle Image Registration for Serial Microscopy Sections, International Conference on Signal-Image Technology & Internet-Based Systems, 2015, 通讯作者
（24） Simulation of anodizing current-time curves and morphology evolution of TiO 2 nanotube arrays, J Solid State Electrochem, 2014, 通讯作者
（25） 还原剂对多孔阳极氧化铝纳米孔道结构的影响, Influence of Reducer on the Nanopore Structure of Porous Anodic Alumina, 物理化学学报, 2012, 通讯作者
（26） Correction of SEM Image Distortion based on Non-equidistant GM(1,1) Model, Proceedings of the 2012 International Conference on Wavelet Analysis and Pattern Recognition, Xian, China, 2012, 第 2 作者
（27） A Fast Acquisition System for Large-scale Optical Microscopic Integrated Circuit Chip Images Based on Thin Plate Spline, Proceedings of the 2012 International Conference on Sensors, Measurement and Intelligent Materials, Guilin, China, 2012, 通讯作者
（28） 多孔阳极氧化物的形成效率与纳米孔道的形成机理, Forming efficiency of porous anodic oxide and formation mechanism of nanopores, 物理学报, 2012, 通讯作者
（29） β展式的误差和函数, The Error-Sum Function of Beta Expansion , 数学的实践与认识, 2011, 通讯作者
（30） Image super-resolution based on image adaptive decomposition, Proc. of SPIE MIPPR 2011: Parallel Processing of Images and Optimization and Medical Imaging Processing, 2011, 通讯作者
（31）  An efficient algorithm and FPGA implementation of video luminance transient improvement, High Technology Letters, 2010, 第 3 作者
（32） Video Luminance Transient Improvement Using Difference-of-Gaussian, Proceedings of the 15th Asia-Pacific Conference on Communications, 2009, 第 3 作者
（33） 经验模式分解算法的分析及其应用, 系统工程理论与实践, 2009, 通讯作者
（34）  A spatial deinterlacing algorithm based on edge orientation optimized in local area, CISP 08 Proceedings of the 2008 Congress on Image and Signal Processing, 2008, 第 2 作者

 

2010级

张旭  硕士研究生  430112-计算机技术  华北电力大学  毕业去向：读博

2011级

胡敏  硕士研究生  085211-计算机技术  华中科技大学  毕业去向：IBM

2014级

曹会文  硕士研究生  085211-计算机技术  天津大学  毕业去向：中科院自动化所

饶强     硕士研究生  081104-模式识别与智能系统  西安交通大学  毕业去向：华为 

2015级

舒畅      直博研究生  081104-模式识别与智能系统  华中科技大学

杨茂柯  硕士研究生  085211-计算机技术  中南大学

肖振鹏  硕士联培生   085211-计算机技术  武汉理工大学

2016级

肖驰     博士研究生  081104-模式识别与智能系统  北京理工大学

刘静     硕士研究生  081104-模式识别与智能系统  西北工业大学

赵盼     硕士联培生  085211-计算机技术    青岛科技大学

2017级

周芳旭 直博研究生  081104-模式识别与智能系统   北京交通大学

江熠     直博研究生  081104-模式识别与智能系统  安徽大学

常胜     硕士研究生  085211-计算机技术  北京化工大学

袁静斌 硕士联培生  085211-计算机技术   北京建筑大学

 

中国科学院自动化所

中国科学院上海神经所

中国科学院生物物理所

清华大学生命学院

北京大学医学部

北京大学信息技术学院

北京生命科学研究院

中国科学技术大学生命学院

北京师范大学脑与认知科学研究院

南开大学化学学院

南京理工大学材料学院

哈佛大学分子与细胞生物系

（ 1 ） 纳米级集成电路设计物理分析技术（国家科技重大专项）, 4473，主持, 国家级, 2009-01--2014-12
（ 2 ） 微观脑网络结构分析与重构（中科院战略先导B类子课题）, 280，主持, 部委级, 2015-07--2017-06
（ 3 ） 中国科学院关键技术人才专项, 30，主持, 部委级, 2016-01--2018-12
（ 4 ） 突触水平神经大数据重建与分析平台研发（北京市科委脑认知与类脑计算专项）, 700，主持, 省级, 2016-05--2018-12
（ 5 ） 生物序列切片高通量扫描电镜三维影像系统（院科研装备研制）, 300，主持, 部委级, 2017-01--2018-12
（ 6 ） 单神经元全脑成像技术研发（卓越中心自主部署）, 50，主持, 部委级, 2016-07--2016-12
（ 7 ） 果蝇视觉系统的微观结构重建及网络分析（自主智能无人机集群协同子课题）,400， 主持, 国家级, 2017-07--2017-08
（ 8 ） 灵长类全脑神经联接图谱计划-微观尺度（国际大科学计划培育项目子课题）, 100，主持, 部委级, 2017-01--2021-12
（ 9 ） 突触水平大脑微观重建技术平台（修购项目）, 600，主持, 部委级, 2016-01--2019-12

 

（1）脑微观重建与智能分析技术   中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心2017年度工作会议   2017-12-01
（2）显微分析技术平台建设   中国科学院生命科学领域区域中心工作交流会   2017-09-27
（3）高通量神经环路连接网络绘制   东方科技论坛-神经环路结构与功能青年学者论坛   2017-08-30
（4）高通量扫描电镜三维重建技术   第二届生物医学成像新技术新方法青年论坛   2017-08-26
（5）突触水平神经大数据重建与分析技术   2016生物显微成像前沿技术培训版暨专题研讨会   2016-12-17
（6）突触水平神经大数据重建与分析平台   中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心2016年度工作会议   2016-11-25
（7）高通量电镜三维重建   第一届神经环路技术研讨会   2016-05-20
（8）微观脑网络结构分析与重构   “脑功能联结图谱与类脑智能研究”先导专项暨卓越中心2015年度总结会议   2015-11-29
（9）基于高通量电镜平台的神经环路重建技术   中国神经科学学会第十一届全国学术会议   韩华   2015-09-22